Entre el segundo y sexto día después de la fecundación se programará la transferencia de embriones, que consiste en colocar el embrión/los embriones a través de una cánula de transferencia en el útero materno.

Es un procedimiento estandarizado. El médico previamente debe hacer una prueba con la cánula de transferencia en la consulta para determinar con antelación el grado de facilidad o de dificultad para la misma. En los casos difíciles, se planteara la posibilidad de realizar una cérvico histeroscopía o dilatación cervical, que debe realizarse en el ciclo previo a la TE.

Para realizar la TE, la paciente es colocada en posición ginecológica, siendo importante que tenga la vejiga llena (aunque no en exceso). Se introduce un especulo estéril para la visualización del cérvix, el mismo que es limpiado con medio de cultivo, procediéndose ademas a retirar el exceso de moco cervical. La/el embrióloga/o carga los embriones en el catéter. Se canaliza el cérvix cuidadosamente hasta el centro de la cavidad endometrial, bajo control ecográfico, donde se inyectan el/los embriones lentamente, aproximadamente a 1,5 cm del fondo uterino, evitando tocarlo, y permaneciendo unos minutos sin mover la cánula para retirar después el catéter lentamente. La/el embrióloga/o comprueba finalmente que no han quedado embriones retenidos en el catéter.

El número de embriones que se pueden transferir es un máximo de tres, tomando en cuenta que los factores que influyen en el número de embriones a colocarse son: la edad de la mujer, el número de hijos previos, la patología uterina, la calidad embrionaria, el fallo en ciclos previos de tratamiento entre otros factores.