Nuestro estudio del microbioma uterino incluye el análisis de todos los patógenos, ya que en patologías como la endometritis aguda (una inflamación del endometrio) que generalmente es asintomática o presenta síntomas inespecíficos como hemorragias uterinas anormales, dolor pélvico o flujo de mal olor, se la ha vinculado como posible causa del fallo de implantación del embrión y del aborto a repetición; sobre todo donde todas las pruebas convencionales conocidas hasta el día de hoy resultan normales. Siendo necesario recurrir a estudios específicos como el examen EMMA que determina si la flora endometrial es óptima para la implantación embrionaria en pacientes con fallo de implantación recurrente y abortos a repetición y el examen Alice que detecta y cuantifica las bacterias patógenas que más comúnmente causan endometritis crónica, recomendando el tratamiento adecuado de antibióticos y probióticos .